Lyra a 20 ans. Déterminée et tourmentée, elle étudie à Sainte-Sophia et tente de trouver sa place dans ce monde. Malcom, devenu professeur, poursuit son idéal de justice. Au coeur d'un monde de plus en plus hostile, en proie aux soubresauts de l'Histoire et aux manipulations politiques, ils s'engagent malgré eux dans un périlleux voyage : le mystère de la Poussière les mènera bien au-delà d'Oxford et des frontières de l'Europe, jusqu'aux lointains déserts d'Asie Centrale et ses cités fantômes.